Sbírka muzea se skládá z nejcennějších předmětů baziliky, nazývané také „Betlém ze Západu“, jako jsou Svaté relikvie, kalinky, ostensories a liturgické roucha.

Položky jsou vystaveny v osmi místnostech a jsou seskupeny podle tématu, od historie baziliky po lidi, kteří v něm hráli důležitou roli, jako je Carlo Borromeo nebo papež Pius IX.

Obrazy zahrnují „Salita al Calvario“ od Sodoma a tři díla Beccafumi: „Madonna Con Bambino“, „Sant'antonio da Padova“ a „Santa Caterina“.

Dalšími zajímavými exponáty jsou staré hudební skóre hudební kaple a autogram Pierluigi da Palestrina.