Das Instrumental Museum der Akademie von Santa Cecilia wurde 1895 unter dem Namen Antike und Moderne Instrumental Museum der Akademie gegründet, um einen umfassenden Überblick über die verschiedenen Instrumententypen der kultivierten und populären Musiktradition zu bieten.

Ihre Ursprünge gehen auf das historische Konzert der Roman Music Society im Mai 1889 zurück, bei dem antike Instrumente gespielt wurden. Fünf von ihnen wurden der Akademie gespendet und im Museum ausgestellt.

Die Sammlung umfasste 1900 77 Instrumente, die teilweise von der Akademie erworben wurden, teilweise von Antiquariaten und Sammlern. Im Jahr 1926 wurde die Sammlung von Lauten und Mandolinen der Königin Margherita von Savoyen, bestehend aus 26 Exemplaren der neapolitanischen und Mailänder Schulen, dem Museum gespendet.

Eine weitere auffällige Anzahl von Exemplaren stammte aus nationalen Wettbewerben zur Kunst der Lauten (1952-56), die von der Akademie gefördert wurden, und aus der Spende des Geigers Gioacchino Pasqualini (1962). Derzeit wird nur ein Teil der 260 Instrumente der Sammlung in Vitrinen gezeigt.

Das wichtigste und bekannteste Exemplar ist die Stradivari-Violine "Il Toscano" des Medicean Quartetts, die 1953 vom italienischen Staat für die Akademie erworben wurde. Die aus dem 16. Jahrhundert stammenden Exemplare von Bogenlauten und das flämische Spinett von 1623 sind wertvoll.

Besonders interessant sind die 80 Exemplare der ethnographischen Abteilung aus Mittel- und Süditalien, Kontinentaleuropa, Zentralafrika, dem Nahen Osten und dem Fernen Osten.