Sie wurde 822 von Paschal I erbaut und oft mit Änderungen am ursprünglichen Aspekt restauriert. Die Fassade, die sich zum Atrium im Freien öffnet, hat Säulen des antiken Narthex und drei gewölbte Fenster. Das basilische Innere war ursprünglich in drei Schiffe mit sechzehn Granitsäulen eingeteilt, die das Trabeation direkt unterstützten. Vier der letzteren wurden dann in verstärkende Pilaster eingebaut, auf denen drei große Querarkaden aufgestellt wurden.

Wunderschön sind die Fresken der Wände mit Geschichten aus dem Passio, Apostelfiguren auf Pilastern, Engeln und Festons, Werke verschiedener Autoren des frühen C. XVII. In der Mitte des Bodens deckt eine Porphyrscheibe einen Brunnen ab, in dem Santa Prassede den Überresten und dem Blut der Märtyrer nach Legenden eingesammelt hat. Die Kapelle von San Zeno ist das wichtigste byzantinische Monument in Rom und sammelt einige der wichtigsten byzantinischen Mosaiken.