En 1231, cette église remplaça la chapelle de l'ancien hospice de St Biagio, où résida St François pendant son séjour à Rome, en 1219. Dans sa cellule, on peut encore trouver le coussin en pierre et son crucifix. Entièrement reconstruite par le cardinal Pallavicini en 1680, l'église regorge de sculptures.

L'intérieur est très simple et est divisé en trois nefs avec de nombreux pilastres. Les allées accueillent chacune trois chapelles.

Dans la chapelle de l'Altieri se trouve la sculpture dramatique de Bernini, la bienheureuse Ludovica Albertoni. Il abrite également un autel de reliquaire du Bernin, ainsi qu'un potraing en toile de saint François, réalisés conformément à la tradition de sa dévote Jacopa de 'Settesoli. Dans l'oratoire se trouve la tombe du grand peintre Giorgio de Chirico.