De eerste kern van de Vaticaanse musea en galerijen was een verzameling oude sculpturen gemaakt door Jules The Second (1503-13).Het idee van het museum werd bedacht door Clement de dertiende (1758-69), die het profane museum opzette met de hulp van Winckelmann.Het Clementine Pious Museum is gemaakt door Clement de veertiende (1769-74) en vrome de zesde (1775-99) en het Chiaramonti Museum werd opgericht door Canova in 1807-1810 onder Pious onder Pious de zevende.In 1822 werd de nieuwe vleugel geopend.Het Etruskische Gregoriaanse museum werd geopend in 1837 en het Gregoriaanse Egyptische museum in 1839, het Profane Lateran Museum (nu het Gregorian Profane Museum) in 1844 en achtereenvolgens het vrome christelijke museum, allemaal onder Gregory de zestiende.In de eerste decennia van de twintigste eeuw werd het etnologische zendingsmuseum opgezet en werd de fotogalerij geopend voor het publiek.In 1973 maakt Paul de zesde het historische museum en de verzameling moderne religieuze kunst inhuldiging.

Clementine Pious Museum -het verzamelt exemplaren van oude sculpturen zoals de Apollo van Belvedere (130-140 AD), de Laocoon Group (eerste eeuw na Christus), de Apollo Sauroktonos en deVenus Cnydia, het kolossale hoofd van Jupiter.Van bijzonder belang zijn de twee Porphyry Sarcophagi van Constance en Saint Helen, respectievelijk dochter en moeder van Constantijn.

Chiaramonti Museum - Het herbergt verschillende Romeinse sculpturen, zoals het standbeeld van Ganymedes, een kolossaal hoofd van Athena, een portret van Tiberius, een opluchting met de drie genaden (eerste eeuw na Christus (eerste eeuw na Christus ().Veel heidense en christelijke inscripties worden tentoongesteld in de Galleria Lapidaria, en beelden zoals de gewonde Amazon, de Spearman, het enorme standbeeld van de Nijl en de Augustus uit Prima Porta worden tentoongesteld in de nieuwe vleugel.

Etruskisch Gregoriaans museum -Het bevat verschillende bevindingen die voornamelijk komen uit de negentiende-eeuwse opgravingen die worden uitgevoerd in Zuid-Etruria, zoals de trousseau van het Regolini-Galassi-graf.De tentoonstelling omvat sarcofagi en een rijke verzameling Griekse, Italiot- en Etruskische vazen.Van bijzonder belang is de tweetalige grafstele van Todi met een dubbele inscriptie in Latinand in Gallische (tweede eeuw voor Christus).

Egyptisch Gregoriaans museum - het werd bedacht door pater Ungarelli, een van de eerste Italiaanse Egyptologen, en verzamelt een reeks beelden die godheden of persoonlijkheden van de koninklijke familie vertegenwoordigen, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moeder, zoals de moederen zus van Ramses de tweede, sarcofagi, mummies en elementen van de begrafenisinrichting.Ook is de standbeelddecoratie van het serapeum in Villa Adriana in Tivoli gereconstrueerd.

Profane Gregorian Museum - het vertoont Griekse en Romeinse sculpturen zoals drie fragmenten van het Parthenon in Athene, het hoofd van Athena (460 v.Chr.), Het altaar van de vicomagistri (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuw (eerste eeuwAd) en twee grote reliëfs die de komst van Vespasianin Rome en het vertrek van Domitianus vertegenwoordigen.Het omvat ook sarcofagi versierd met mythologische onderwerpen De groep Athena en Marsia onderscheidt zich van de bronzen kopieën.

Christian Pioom Museum -Het verzamelt materialen afkomstig van de opgravingen van de Romeinse catacomben, verschillende sarcofagen (derde eeuw na Christus), waarvan er één een kopie is van de sarcofaag van JuniusBassus en het standbeeld van de Good Shepherd (derde eeuw na Christus).

Ethnological Missionary Museum - het documenteert de religieuze gebeurtenissen en de culten van andere continenten.Van bijzonder belang zijn de vijftiende -eeuwse Aztec -sculpturen, de Indiase sculpturen van hindoeïstische goden, de rituele maskers uit Oceanië en Afrika.

Collectie van moderne religieuze kunst - gedeeltelijk opgericht in de kamers van het Borgia -appartement, ingericht door Pinturicchio, vertoont het werken van Rosai, Boccioni, Balla, de Chirico, Guttuso, enManzù.

Upper Galleries - De galerij van Candelabra verzamelt archeologisch materiaal van het Romeinse tijdperk, zoals de sculptuurgroep van Ganymedes en de Eagle (tweede eeuw na Christus) en het standbeeld van Artemis.De galerij van wandtapijten vertoont wandtapijten van de zestiende -eeuwse Vlaamse en de Romeinse productie van de zeventiende eeuw.De galerij van geografische kaarten vertoont 40 panelen gewijd aan het grondgebied van Italië gemaakt in 1580-83.

Vaticaanse bibliotheekmuseum - Het herbergt verschillende getuigenissen van heilige kunst: de Hall of the Aldobrandini -bruiloft met fresco's van het Romeinse tijd, de Hall of Papyri met vergulde bril van de vroege christelijke leeftijd, de Sixtijnse hal met fresco's van Cesare Nebbia en andere kunstenaars, de Pauline Halls, de Alexandrine Hall en de Clementine Gallery met schetsen van Bernini