Катакомбы Сан-Каллисто - самые известные из римских катакомб и первые официальные подземные захоронения для ранних христиан, включая многих мучеников второго и третьего веков. Вероятно, именно Каликстус был главным ответственным за то, что Церковь стала законным владельцем кладбищ. Каликст был назначен администратором кладбища, которое носит его имя папа Зефирин. В 217 году он сменил Зефирина как папу и через пять лет умер.

Раскопки показали пять различных уровней локусов, ниш, где тела, завернутые в листы, были размещены в ярусах. Отверстия в локусы были закрыты мраморными плитами, но они давно исчезли, как и любые ценные артефакты. Главной достопримечательностью является папский склеп с останками нескольких мучеников ранних пап. Неподалеку, с византийскими фресками, находится Кубикул Св. Сесилии, тело которого было обнаружено здесь папой Пасхальным I и перенесено в Санта-Сесилию в Трастевере. В других кабинах на стенах вырезаны фрески и христианские символы. В склепе святого Евсевия находится саркофаг, содержащий два мумифицированных тела.