Instrumental Museum of the Academy of Santa Cecilia grundades 1895 med namnet Ancient and Modern Instrumental Museum of the Academy, i syfte att erbjuda en stor överblick över de olika typerna av instrument från den kulturerade och populära musikaliska traditionen.

Dess ursprung går tillbaka till den historiska konserten som främjades av det romerska musikaliska samhället i maj 1889, under vilket forntida instrument spelades.Fem av dem donerades till akademin och ställs ut i museet.

1900 räknade samlingen 77 instrument, delvis köpt av akademin, delvis donerad av antikvarier och samlare.1926 donerades samlingen av lutor och mandoliner från drottning Margherita i Savoy, bestående av 26 prover av de napolitanska och milanesiska skolorna till museet.

Ett annat iögonfallande antal exemplar kom från nationella tävlingar om konsten att göra lutar (1952-56) som främjades av akademin och från donationen 1962 av violinisten Gioacchino Pasqualini.För närvarande visas endast en del av de 260 instrumenten i samlingen i utställningar.

Det viktigaste och mest kända exemplet är Stradivari -fiolen som kallas "Il Toscano" av den medicinska kvartetten som köpts 1953 av den italienska staten för akademin.Proverna av bågslutar daterade tillbaka till det sextonde århundradet och den flamländska spinetten 1623 är värdefulla.

De 80 proverna i den etnografiska sektionen kommer från centrala och södra Italien, det kontinentala Europa, Centralafrika, Mellanöstern och Fjärran Östern är av särskilt intresse.